Si lo que quieres es ignorar los cambios de un archivo que ya esta en el repositorio, sin borrar el archivo del mismo repositorio ejecuta el siguiente comando.
git update-index --assume-unchanged <paht y nombre del archivo>Pone el archivo en una lista en donde asume que nunca a cambiado, por lo tanto se logra que ignoré los futuros cambios.
fuente: https://qastack.mx/programming/936249/how-to-stop-tracking-and-ignore-changes-to-a-file-in-git